脾胃病科于1993年成立，是国家卫生健康委员会临床重点脾胃病专科；国家区域中医诊疗中心培育单位，国家中医药管理局“十一五”重点专科，国家中医优势专科，国家中医药管理局中医优势病种（胃缓·胃下垂）协作组牵头单位，国家中医药管理局第二批中医诊疗模式（便秘、消化道肿瘤）创新试点单位，国家药物临床试验机构；福建省中医脾胃医学中心，福建省中医脾胃病重点专科；福建省中医重点脾胃研究室、实验室；福建省中医药继续教育项目基地；世界中医药学会联合会消化病专业委员会首任会长，现任名誉会长、副会长，世界中医药学会联合会盆底专业委员会副会长，中华中医药学会脾胃病分会副主任委员、青年委员会副主任委员，中西医结合学会消化病分会副主任委员，中国中西医结合学会消化系统疾病专业委员会慢性便秘专家委员会主任委员，中国医疗保健国际交流促进会中西医结合消化病学分会副主任委员，中国民族医药学会脾胃病分会副会长所属单位；福建省中医药学会脾胃分会、福建省中西医结合学会消化系统疾病分会、福建省中医药学会消化内镜专业委员会主任委员所属单位。福建中医药大学脾胃研究所挂靠科室。

专科拥有医生26名，护士35名，其中国医大师1名，高级职称人员13名，博士后1名，博士5名，硕士13名，博士生导师5名，硕士生导师8名。开设脾胃病门诊、病区及胃肠内镜室、脾胃研究室（胃肠动力室、呼气实验室）、中医综合治疗室等功能科室。建设有国医大师杨春波工作室、柯晓福建省名老中医药专家传承工作室。现有核定床位 70张，年均门诊量逾 12万人次，年收治患者 2300余人次。

专科先后承担国家“十五”攻关课题、国家自然科学基金课题、福建省卫生厅、科技厅、教育厅等科研课题 50余项，获中国中西医结合学会科技成果奖三等奖一项，福建省科技进步奖二项，福建省医药卫生科技进步奖四项。专科先后创制了清化饮、清肠液、十香止痛贴、七味消胀贴、利胆排石合剂、胃血宁合剂、益胃宁胶囊、健脾清化散瘀饮等 10 种院内制剂。

在专科学术带头人国医大师杨春波教授、专科负责人柯晓主任的带领下，脾胃病专科已经形成胃肠病、肝胆胰病、消化道肿瘤、消化内镜四个亚专业方向，已构建合理的学术人才梯队。专科突出杨氏脾胃湿热理论研究及临床应用；发挥中医综合治疗在慢性脾胃病中作用；擅长炎症性肠病、功能性胃肠病、消化道出血等胃肠疾病，急慢性胰腺炎、胆囊炎、脂肪肝、肝硬化等肝胆胰疾病，消化道肿瘤化疗以及胃肠道早癌 EMR、ESD 手术、胆总管结石 ERCP 术以及胃肠道支架置入等疾病的治疗；发挥福建省中医脾胃医学中心平台优势，在消化道大出血、重症胰腺炎、重症溃疡性结肠炎、慢性功能性便秘、胆石症等危重、疑难疾病的治疗上，整合肛肠科、普外科、ICU 等形成多中心协作（MDT)中西并重新模式，把传统与现代相结合，发挥中医、西医两种医学优势，更好为广大患者服务。